Articles

Home-Tetrahymena thermophila SB210

Posted by admin
Tetrahymena thermophila

de genoomsequentie van de eencellige ciliaat Tetrahymenathermophila werpt licht op de vroege eukaryotische evolutie. Foto van robinsonr (2006) Ciliate genoomsequentie onthult unieke kenmerken van een Modelleukaryote. PLoS Biol 4 (9): e304.doi: 10.1371 / journal.pbio.0040304. CC BY2. 5 via WikimediaCommons.

de genoomsequentie en genmodellen van Tetrahymenathermophila werden niet bepaald door het Joint Genome Institute(JGI), maar werden gedownload van NCBIon 31 mei 2018. Om vergelijkende analyses met othergenomes toe te staan die door JGI worden gerangschikt, wordt een exemplaar van dit genoom opgenomen in het Genoomportaal van JGI. De hulpmiddelen van JGI werden gebruikt om automatisch voorspelde proteã nen te annoteren. Houd er rekening mee dat deze kopie van thegenome niet wordt onderhouden door NCBI en daarom niet automatisch wordt bijgewerkt.

de volgende tekst komt van het NCBI-genoom:

Tetrahymena thermophila

Tetrahymena thermophila is een vrijzwemmendeunicellulaire protist. Dit zoetwaterorganisme bewoont stromen, meren en vijvers. Net als andere ciliaten hebben Tetrahymenacellen een complexe genoomstructuur. Elke cel bevat een diploidmicronucleus (mic) en een somatische macronucleus (mac).De twee kernen onafhankelijk en hebben verschillende functies en chromosomale regelingen. De mic is georganiseerd in 5 paren van chromosomen en ondergaat mitotische en meiotische verdeling maar wordt niet getranscribeerd. In tegenstelling, tijdens de vorming van de mac, ondergaan deze chromosomen plaats-specifieke fragmentatie in ongeveer 200-300chromosomen variërend in grootte van 21 kb tot >3000 kb waaraan elomeric Uiteinden De novo worden toegevoegd. Tijdens dit proces,wordt ongeveer 10% van het genoom verwijderd. De chromosomen van de Mac worden aan een ploidy van ongeveer 45 exemplaren behalve het 21kb ribosomal minichromosoom van DNA dat aan ~9000 exemplaren wordt versterkt.Transcriptie en vertaling komen voor in de macronucleus. T. thermophila wordt gebruikt in bioassays en heeft potentieel voor industriële eiwitsynthese en biocontrol van ziekten veroorzaakt door verwante organismen.

Genoomreferentie(s)

vermeld de volgende Publicatie (s) als u de gegevens van dit genoom gebruikt in uw onderzoek:
Eisen JA, Coyne RS, Wu-M, Wu-D, Thiagarajan M, wortman in werking gezet JR, Das JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smit RK Jr, Garg J, Pearlman OPNIEUW, Karrer KM, Zon L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, de Beschermheilige NJ, Cherry JM, Stover NA, Krieger CJ, del Toro C, Ryder HF, Williamson SC, Barbeau RA, Hamilton EP, Orias E
Macronuclear genoom sequentie van het ciliaat Tetrahymena thermophila, een model eukaryote.
PLoS Biol. 2006 Sept; 4 (9): e286. doi: 10.1371 / journal.pbio.0040286

Related Post

Leave A Comment