Articles

Koti-Tetrahymena thermophila SB210

Posted by admin
Tetrahymena thermophila

yksisoluisen ciliate Tetrahymenathermophilan genomisekvenssi valottaa varhaista eukaryoottista evoluutiota. Valokuva robinsonr (2006) Ciliate genomi sekvenssi paljastaa ainutlaatuisia ominaisuuksia ModelEukaryote. PLoS Biol 4(9): e304.doi: 10.1371 / lehti.pbio.0040304. CC BY2. 5 kautta WikimediaCommons.

joint Genome Institute(JGI) ei määrittänyt Tetrahymenathermophilan genomisekvenssiä ja geenimalleja, vaan ne ladattiin Ncbionista 31.toukokuuta 2018. JGI: n Genomiportaaliin sisällytetään kopio tästä genomista, jotta voidaan tehdä vertailevia analyyseja muiden JGI: n sekvensoimien genomien kanssa. JGI työkaluja käytettiin automaticallyannotate ennustettuja proteiineja. Huomaa, että NCBI ei ylläpidä tätä genomin kopiota, eikä sitä siksi päivitetä automaattisesti.

seuraava teksti on peräisin NCBI: n genomista:

Tetrahymena thermophila

Tetrahymena thermophila on vapaauimaprotisti. Tämä makean veden eliö elää puroissa, järvissä ja lammissa. Kuten muillakin siileillä, Tetrahymenasoluilla on monimutkainen genomirakenne. Jokainen solu sisältää diploidmikronukleuksen (mic) ja somaattisen makronukleuksen (mac).Nämä kaksi nukleifunktiota ovat toisistaan riippumattomia ja niillä on erilliset funktiot ja kromosomijärjestelyt. Mic on järjestetty 5 paria kromosomeja ja undergoes mitoottinen ja meioottinen jakautuminen, mutta ei transkriboitu. Incontrast, aikana muodostumista mac, nämä kromosomit undergo site-spesifinen pirstoutuminen noin 200-300kromosomit vaihtelevat kooltaan 21 kb >3000 kb johon telomeeriset päät lisätään de novo. Tämän prosessin aikana perimästä poistuu noin 10%. Mac-kromosomit onamplifioitu ploidiaksi noin 45 kopiota lukuun ottamatta 21kb ribosomaalista DNA-MINIKROMOSOMIA, joka monistetaan ~9000 kopioon.Transkriptio ja translaatio tapahtuvat makronukleuksessa. T. thermophilaa käytetään biotesteissä, ja sillä on potentiaalia teolliseen proteiinisynteesiin ja siihen liittyvien eliöiden aiheuttamien sairauksien biokontrolliin.

Genomiviitteet

mainitse seuraavat julkaisut, jos käytät tämän genomin tietoja tutkimuksessasi:
Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK Jr, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, asai DJ, Wilkes de, Wang y, CAI h, Collins K, Stewart Ba, Lee Sr, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig j, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky ma, Keeling PJ, Waller RF, patron NJ, Cherry JM, Stover na, Krieger CJ, del Toro C, Ryder HF, Williamson SC, Barbeau RA, Hamilton EP, Orias E
Macronuclear Genome sekvenssi ciliate Tetrahymena thermophila, malli eukaryote.
PLoS Biol. 2006 syys;4 (9): e286. doi: 10.1371 / lehti.pbio.0040286

Related Post

Leave A Comment