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Tetrahymena thermophila

La secuencia del genoma del Tetrahymenathermophila ciliado unicelular arroja luz sobre la evolución eucariótica temprana. Foto de Robinsonr (2006) Secuencia de Genoma Ciliado Revela Características Únicas de un modelo de Eucariota. PLoS Biol 4 (9): e304.doi: 10.1371 / journal.pbio.0040304. CC BY2.5 a través de WikimediaCommons.

La secuencia del genoma y los modelos genéticos de Tetrahymenathermophila no fueron determinados por el Joint Genome Institute(JGI), pero se descargaron de NCBIon el 31 de mayo de 2018. Para permitir análisis comparativos con otros genes secuenciados por el JGI, se incorpora una copia de este genoma al Portal del Genoma del JGI. Se utilizaron herramientas JGI para no neutralizar automáticamente las proteínas predichas. Tenga en cuenta que esta copia del genome no es mantenida por NCBI y, por lo tanto, no se actualiza automáticamente.

El siguiente texto proviene del genoma de NCBI:

Tetrahymena thermophila

Tetrahymena thermophila es un protista unicelular de natación libre. Este organismo de agua dulce habita en arroyos, lagos y estanques. Al igual que otros ciliados, las células tetrahiménicas tienen una estructura genómica compleja. Cada célula contiene un diploidmicronúcleo (cmi) y un macronúcleo somático (mac).Las dos nucleifunciones son independientes y tienen funciones y arreglos cromosómicos distintos. La cmi está organizada en 5 pares de cromosomas y se divide en mitosis y meiótica, pero no se transcribe. En contraste, durante la formación de la mac, estos cromosomas pasan por la fragmentación específica del sitio en aproximadamente 200-300 cromosomas que varían en tamaño de 21 kb a >3000 kb a los que se agregan extremos teloméricos de novo. Durante este proceso,se extrae aproximadamente el 10% del genoma. Los cromosomas Mac se amplifican a una ploidía de aproximadamente 45 copias, excepto para el minicromosoma de ADN ribosómico de 21 kb, que se amplifica a ~9000 copias.La transcripción y la traducción ocurren en el macronúcleo. T. thermophila se utiliza en bioensayos y tiene potencial para la síntesis de proteínas industriales y el biocontrol de enfermedades causadas por organismos afines.

Referencias del genoma

Por favor, cite las siguientes publicaciones si utiliza los datos de este genoma en su investigación:
Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK Jr, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA, Krieger CJ, del Toro C, Ryder HF, Williamson SC, Barbeau RA, Hamilton EP, Orias E
Genoma macronuclear secuencia de la termófila Tetrahymena ciliada, un modelo de eucariota.
PLoS Biol. Septiembre de 2006; 4 (9): e286. doi: 10.1371 / journal.pbio.0040286

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