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 Tetrahymena thermophila

Die Genomsequenz des einzelligen Ciliaten Tetrahymenathermophila gibt Aufschluss über die frühe eukaryotische Evolution. Foto ausrobinsonr (2006) Die Ciliatengenomsequenz zeigt einzigartige Merkmale eines Modelleukaryoten. PLoS Biol 4(9): e304.doi:10.1371/Zeitschrift.pbio.0040304. CC BY2.5 über WikimediaCommons.

Die Genomsequenz und Genmodelle von Tetrahymenathermophila wurden nicht vom Joint Genome Institute (JGI) bestimmt, sondern am 31. Mai 2018 vom NCB heruntergeladen. Um vergleichende Analysen mit anderen vom JGI sequenzierten Genomen zu ermöglichen, wird eine Kopie dieses Genoms in das JGI-Genomportal integriert. JGI-Tools wurden verwendet, um automatisch vorhergesagte Proteine zu notieren. Bitte beachten Sie, dass diese Kopie des Genoms nicht von NCBI gepflegt wird und daher nicht automatisch aktualisiert wird.

Der folgende Text stammt aus dem NCBI-Genom:

Tetrahymena thermophila

Tetrahymena thermophila ist ein freischwimmender einzelliger Protist. Dieser Süßwasserorganismus bewohnt Bäche,Seen und Teiche. Wie andere Ciliaten, Tetrahymenazellenhaben eine komplexe Genomstruktur. Jede Zelle enthält einen Diploidmicronucleus (mic) und einen somatischen Macronucleus (mac).Die zwei nucleifunction unabhängig und haben verschiedene Funktionen und chromosomalarrangements. Das MHK ist in 5 Chromosomenpaare unterteilt unddurchläuft mitotische und meiotische Teilung, wird aber nicht transkribiert. Im Gegensatz dazu durchlaufen diese Chromosomen während der Bildung des mac eine ortsspezifische Fragmentierung in ungefähr 200-300chromosomen mit einer Größe von 21 kb bis > 3000 kb, zu der de novo telomere Enden hinzugefügt werden. Während dieses Prozesses werden ungefähr 10% des Genoms entfernt. Mac Chromosomen areamplified zu einem ploidy von ungefähr 45 Kopien außer dem 21kb ribosomal DNA minichromosome, das zu ~9000 Kopien verstärkt wird.Transkription und Translation finden im Makronukleus statt. T.thermophila wird in Bioassays verwendet und hat Potenzial für industrielle Proteinsynthese und Biokontrolle von Krankheiten, die durch verwandte Organismen verursacht werden.

Genomreferenz(en)

Bitte zitieren Sie die folgenden Publikationen, wenn Sie die Daten aus diesem Genom in Ihrer Forschung verwenden:
Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Dachs JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Schmied RK Jr, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sonne L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE , Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Kirsche JM, Stover NA, Krieger CJ, del Toro C, Ryder HF, Williamson SC, Barbeau RA, Hamilton EP, Orias E
Makronukleares Genom sequenz des Ciliaten Tetrahymena thermophila, eines Modell-Eukaryoten.
PLoS Biol. 2006 September;4(9):e286. doi: 10.1371/Zeitschrift.pbio.0040286

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